黑鲷病害防治必须坚持以预防为主、综合防治的原则。如何预防呢？首先，定期在饲料中添加适量的大蒜素、复合维生素；其次，要用3％~5％食盐水或是高锰酸钾（100斤水用1克高锰酸钾）进行鱼体浸泡洗消毒3~15分钟。每隔10~15天用10kg/ha~20kg/ha的生石灰或漂白粉全池消毒。

为了减少黑鲷病害，防治工作要落实到实处。养殖场负责人早晚各巡塘一次，观察水色、黑鲷活动和摄食情况，及时捞除残饵、死鱼，同时检查塘基有无渗漏，每日定时分两次进行水质指标测定。一旦发现水体有异常情况即刻着手处理。在高温、闷热、阴雨天气，可适当增加增氧机开机时间，通过营造优良的水体环境来增强黑鲷的免疫力。

黑鲷养殖还要坚持周期性杀虫，他表示温度若是低于18℃~23℃，黑鲷则容易得寄生虫病。寄生虫病（主要是鱼虱）主要寄生在黑鲷的胸鳍和鳃。初期并无不适，伤口处因表皮破坏后，容易感染体表性疾病和并发症，防治不及时或是杀虫不彻底，会造成黑鲷不间断零星死亡。